На это у вас уйдёт пара кликов: откройте в 1С меню «Главное» — «Организации».

Если организаций много, найдите нужную через Поиск.

Перейдите на вкладку «Банковские счета». Выберете нужный счёт и укажите дату закрытия — она может быть любой, это ни на что не повлияет. Затем нажмите «Записать и закрыть».
